57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1627 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 369 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 380 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  30.85 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  30.85 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  30.85 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 374 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  29.79 
 
 		 374 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 374 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  32.53 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  33.93 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9872  hypothetical protein  31.63 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  28.09 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 301 aa  42.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  31.94 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  28.09 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  28.09 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  38.89 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 115 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 219 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 219 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 219 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1577  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0936  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  26.97 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  32.31 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  32.31 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  32.31 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 92 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>