More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1617 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  280  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  61.03 
 
 
139 aa  176  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  51.61 
 
 
145 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 
139 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
138 aa  140  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 
134 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  41.8 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  35.9 
 
 
155 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
149 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  36.75 
 
 
155 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  36.75 
 
 
155 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
146 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.38 
 
 
137 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.87 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 
136 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
137 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
138 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
138 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.72 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  42.99 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.88 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  35.65 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.65 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
155 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  35.48 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.25 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
145 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.28 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  28.03 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.67 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.96 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  34.15 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.15 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.1 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.17 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  36 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  33.85 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.13 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.17 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.17 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.83 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.17 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.17 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.17 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.16 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.45 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  30.09 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>