More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1600 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  74.02 
 
 		 204 aa  323  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  63.05 
 
 		 205 aa  281  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  60.89 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  63.37 
 
 		 200 aa  268  5e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  61.08 
 
 		 206 aa  265  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  60.5 
 
 		 205 aa  260  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  57.64 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  59.2 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  48.6 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  49.24 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  47.29 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  47.24 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  48.22 
 
 		 198 aa  208  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  46.73 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  49.5 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  47.29 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  47.24 
 
 		 198 aa  204  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  47.76 
 
 		 204 aa  204  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  204  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  48.96 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  48.19 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  47.4 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  46.73 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  47.24 
 
 		 198 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  46.08 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  47.87 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 197 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  46.23 
 
 		 198 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  46.08 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  46.23 
 
 		 198 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  46.73 
 
 		 198 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  46.23 
 
 		 198 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  50 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  48.24 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  45.6 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  44.67 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  50 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000136854  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 202 aa  194  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  44.72 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  46.35 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  50 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  48.35 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  48.35 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  48.94 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  47.18 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  48.35 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  50 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  46.73 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>