More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1542 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
374 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  53.37 
 
 
374 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  48.1 
 
 
371 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  46.28 
 
 
379 aa  318  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  45.04 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  44.56 
 
 
376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  38.77 
 
 
376 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  42.26 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  37.63 
 
 
376 aa  269  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  38.93 
 
 
376 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  36.29 
 
 
376 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  36.07 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  37.87 
 
 
376 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  35.5 
 
 
373 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
399 aa  215  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  33.7 
 
 
377 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  34.81 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  32.14 
 
 
374 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30.2 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.76 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.79 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
374 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.49 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.51 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.82 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  29.01 
 
 
421 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30.03 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 
419 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.63 
 
 
377 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.97 
 
 
393 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.69 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
404 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.49 
 
 
378 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.16 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.14 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.88 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.59 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.06 
 
 
388 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
395 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.87 
 
 
369 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  29.77 
 
 
423 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.93 
 
 
377 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.57 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.98 
 
 
399 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.53 
 
 
404 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.26 
 
 
397 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 
384 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 
386 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.93 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  27.16 
 
 
382 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.26 
 
 
422 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
388 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.65 
 
 
408 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  29.14 
 
 
448 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  25.5 
 
 
388 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.25 
 
 
410 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  30.4 
 
 
384 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.46 
 
 
397 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.4 
 
 
408 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.33 
 
 
389 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 
384 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 
384 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  29.24 
 
 
388 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.86 
 
 
362 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.45 
 
 
408 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.93 
 
 
368 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  26.36 
 
 
362 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 
371 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.65 
 
 
368 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  25.67 
 
 
414 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 
376 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 
399 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.38 
 
 
395 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  25.67 
 
 
414 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.59 
 
 
396 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  25.43 
 
 
414 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 
362 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.81 
 
 
400 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.29 
 
 
393 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 
376 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  25.18 
 
 
440 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  25.18 
 
 
440 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
367 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  42.37 
 
 
123 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  25.18 
 
 
440 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  25.18 
 
 
440 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.9 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 
376 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
380 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.9 
 
 
364 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.15 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  26.94 
 
 
420 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.7 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.84 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  27.17 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>