More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1520 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  62.96 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  55.69 
 
 		 179 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  59.46 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  50.55 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  48.48 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  47.12 
 
 		 192 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  49.65 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  47.2 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  51.06 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.4 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  39.39 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  42.22 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.13 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  30.58 
 
 		 223 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  35.18 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.41 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  40 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 248 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  37.76 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.06 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.78 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.83 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  42.45 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.97 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.76 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  35.51 
 
 		 239 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  33.53 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.94 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.27 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  37.68 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  37.68 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  33.33 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  33.16 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  35.8 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  41.56 
 
 		 172 aa  95.5  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.86 
 
 		 231 aa  95.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.36 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  41.77 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.66 
 
 		 246 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  38.24 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  37.5 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  39.19 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  32.73 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  40.88 
 
 		 185 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  37.96 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  33.9 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.5 
 
 		 282 aa  91.7  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  33.57 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  35.25 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  35.25 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  33.92 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.86 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.89 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  34.09 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  38.1 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.81 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  36.5 
 
 		 286 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  30.68 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  41.61 
 
 		 169 aa  88.6  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.11 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  33.82 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  37.21 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.42 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  33.33 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.36 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.23 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32.74 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.51 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  34.48 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  30.36 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  35.4 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  31.68 
 
 		 260 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  31.95 
 
 		 178 aa  84.7  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 189 aa  84.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 176 aa  84.7  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.97 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  32.67 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.19 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>