213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1488 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
234 aa  490  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  63.25 
 
 
235 aa  317  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  51.71 
 
 
233 aa  252  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  50.22 
 
 
242 aa  247  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  47.01 
 
 
234 aa  236  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  52.43 
 
 
209 aa  224  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  45.26 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  47.66 
 
 
223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  42.17 
 
 
235 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  43.2 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 
213 aa  195  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  43.29 
 
 
235 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  42.55 
 
 
243 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  42.67 
 
 
256 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  42.24 
 
 
235 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  47.14 
 
 
213 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  42.38 
 
 
244 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 
244 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  41.74 
 
 
243 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  41.74 
 
 
243 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  41.74 
 
 
243 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  42.04 
 
 
243 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
240 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  41.7 
 
 
243 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  42.04 
 
 
243 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  41.59 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
270 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  41.59 
 
 
243 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  41.15 
 
 
243 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  45.85 
 
 
212 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  40.6 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 
239 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 
208 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.75 
 
 
218 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 
239 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  41.31 
 
 
230 aa  168  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 
250 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  40.97 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  37.85 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40.4 
 
 
227 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 
237 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
238 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  36.8 
 
 
241 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  36.24 
 
 
231 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  35.34 
 
 
238 aa  148  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  35.34 
 
 
228 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
207 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 
203 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
237 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 
229 aa  141  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  38 
 
 
237 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 
223 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
210 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
215 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.18 
 
 
215 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 
221 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  33.33 
 
 
223 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.62 
 
 
219 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
215 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
227 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
211 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
221 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  31.25 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  30.24 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  31.25 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 
248 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  30.81 
 
 
223 aa  118  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
224 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  32.39 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  37.31 
 
 
222 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
215 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
218 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  33.8 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>