120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1420 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  65.18 
 
 		 518 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 530 aa  1090    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  66.53 
 
 		 518 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  54.93 
 
 		 1585 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  44.67 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  37.77 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 		 665 aa  326  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  38.15 
 
 		 746 aa  325  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  47.76 
 
 		 1338 aa  306  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 1195 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  33.66 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.26 
 
 		 691 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  34.98 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 521 aa  250  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  31.38 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  38.89 
 
 		 901 aa  199  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 543 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 532 aa  183  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.8 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.53 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.1 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  25.51 
 
 		 519 aa  154  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 560 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 		 522 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 		 522 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  27.61 
 
 		 566 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  28.66 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.29 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.68 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.31 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.82 
 
 		 538 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.6 
 
 		 577 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.91 
 
 		 536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.14 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.19 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  28.36 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.25 
 
 		 523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  26 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 514 aa  114  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.16 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.75 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.7 
 
 		 541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25.15 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  29.69 
 
 		 542 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 546 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.36 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.95 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  26.31 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.13 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.96 
 
 		 488 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  30.12 
 
 		 522 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.41 
 
 		 1474 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 581 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 		 797 aa  97.8  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  27.04 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.46 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 		 571 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  23.52 
 
 		 553 aa  88.6  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  25.73 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  28.83 
 
 		 524 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.91 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.1 
 
 		 540 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  25.39 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.15 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  23.08 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.39 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.96 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 537 aa  70.1  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  30.74 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  31.68 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.63 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  32.1 
 
 		 591 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  28.04 
 
 		 713 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  21.37 
 
 		 699 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  28.87 
 
 		 317 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 345 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  21.06 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>