26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1383 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1002    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  50.68 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  32.61 
 
 		 483 aa  272  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  28.27 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  23.95 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  21.29 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  23.71 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  21.94 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.61 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  23.19 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  22.42 
 
 		 495 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  21.81 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  23.51 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  20.19 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  21.99 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  20.81 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  20.05 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.22 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  21.27 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  21.77 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  23.42 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  22.37 
 
 		 544 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  21.88 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  20.49 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  21.62 
 
 		 511 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  21.9 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>