37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1197 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  51.3 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  46.49 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  42.92 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  36.18 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  31.8 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  30.83 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  27.87 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  35 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  29.33 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  28.03 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  27.39 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  25.32 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.1 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  21.36 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  30.43 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3110  DNA repair protein RecO  24.26 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0026851  normal  0.0227356 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  31.16 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1203  DNA repair protein RecO  24.26 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0374149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  24.79 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  23.03 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1280  DNA repair protein RecO  23.76 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.588723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1247  DNA repair protein RecO  24.14 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00802629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>