More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1196 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  89.3 
 
 		 243 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  80.66 
 
 		 245 aa  407  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  77.08 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  74.38 
 
 		 243 aa  379  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  71.49 
 
 		 244 aa  358  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  70.25 
 
 		 246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  69.83 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  68.18 
 
 		 246 aa  349  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  69.42 
 
 		 247 aa  348  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  66.11 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  67.08 
 
 		 244 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  65.27 
 
 		 244 aa  327  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  65.27 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  64.85 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  64.44 
 
 		 244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  63.18 
 
 		 244 aa  317  9e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  63.18 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  63.29 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  60.92 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  60.92 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.92 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  58.68 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  59.66 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  58.16 
 
 		 239 aa  294  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  59 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.74 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.54 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  61.28 
 
 		 242 aa  294  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.74 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  58.4 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.33 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.96 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  58.4 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  60.34 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  58.4 
 
 		 253 aa  291  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  58.4 
 
 		 253 aa  291  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  61.6 
 
 		 245 aa  292  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  58.4 
 
 		 265 aa  291  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  57.81 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  58.8 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.98 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  56.54 
 
 		 246 aa  288  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2272  ABC transporter related  60.34 
 
 		 242 aa  288  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  56.54 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  56.72 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  57.61 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  57.61 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.38 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  56.72 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  58.23 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  58.8 
 
 		 271 aa  284  9e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.56 
 
 		 336 aa  284  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.57 
 
 		 332 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  60.34 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  57.2 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  56.12 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.85 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  60.34 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  59.17 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  58.37 
 
 		 288 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  55.79 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.3 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  58.7 
 
 		 333 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  57.56 
 
 		 283 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  55.7 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  57.83 
 
 		 263 aa  281  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  58.62 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  56.12 
 
 		 259 aa  281  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55.46 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  56.72 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.3 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  56.3 
 
 		 290 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  58.7 
 
 		 316 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0478  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.72 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.72 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>