More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1116 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  65.44 
 
 		 220 aa  300  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  61.47 
 
 		 220 aa  275  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  57.14 
 
 		 219 aa  268  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  60 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  52.75 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  59.02 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  49.55 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  51.24 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  49.25 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  48.04 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  48.04 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  43.42 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  46.86 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  46.54 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  45.54 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  48.04 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  47.06 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  46.53 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  44.88 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  45.32 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  44.88 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  45.27 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.21 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  44.66 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.21 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  46.57 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  47.8 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.84 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.55 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  42.36 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  46.31 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  45.81 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  42.65 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  44.88 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  44.75 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  41.95 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.57 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.06 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  42.51 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  42.57 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.08 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  42.42 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.66 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.61 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  42.57 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  42.44 
 
 		 271 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  43.27 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.72 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  45.05 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  45.59 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42.57 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  40.91 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.96 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  41.46 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.5 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  41.58 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  43.63 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  41.09 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.7 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  39.55 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.2 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  40.3 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  40.3 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.27 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.18 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.79 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  41.55 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  42.16 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 269 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.32 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  42.16 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  38.71 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  41.75 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  38.07 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  38.1 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  41.31 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  39.5 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.1 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>