More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1054 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 157 aa  306  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  80.25 
 
 		 160 aa  261  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  73.72 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  65.61 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  63.46 
 
 		 157 aa  201  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  60.51 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 159 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  46.98 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  45.64 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  46.58 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  45.27 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  45.27 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  45.33 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  44.3 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0255  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000533555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  41.89 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  45.19 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 168 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 203 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>