More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1039 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1259 aa  2612    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 
752 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.8 
 
 
1258 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
1406 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
1066 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
1043 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
1178 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
1484 aa  362  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 
475 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
930 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
728 aa  293  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  47.79 
 
 
1105 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
1138 aa  217  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1741 aa  215  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
1516 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
1118 aa  190  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
1043 aa  189  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
661 aa  187  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
1714 aa  185  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
957 aa  184  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.97 
 
 
858 aa  181  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.26 
 
 
1927 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  25.13 
 
 
749 aa  180  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
884 aa  178  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
986 aa  177  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
3706 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
816 aa  172  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 
1611 aa  171  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
1245 aa  170  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1808 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.4 
 
 
1182 aa  169  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1267 aa  168  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
498 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 
1578 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 
1501 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1059 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
1064 aa  161  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.55 
 
 
1069 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1931  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.65 
 
 
1289 aa  159  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0959119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1622 aa  158  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  28.54 
 
 
683 aa  158  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  28.54 
 
 
669 aa  158  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
810 aa  156  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
500 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 
989 aa  155  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 
1060 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 
1611 aa  154  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.18 
 
 
1452 aa  154  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  28.09 
 
 
685 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
373 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.92 
 
 
933 aa  153  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
383 aa  153  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 
1070 aa  153  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
639 aa  152  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
600 aa  151  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
679 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
691 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
373 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
989 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
1344 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
376 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
1068 aa  149  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
389 aa  149  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
389 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
797 aa  148  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
387 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  24.95 
 
 
931 aa  147  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  25.44 
 
 
1629 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 
1166 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
761 aa  147  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
654 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
421 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  25.81 
 
 
774 aa  146  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 
1807 aa  145  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.38 
 
 
1820 aa  145  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
499 aa  145  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
874 aa  145  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
591 aa  145  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
1297 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 
774 aa  144  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  25.87 
 
 
623 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
738 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.91 
 
 
1266 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
637 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.76 
 
 
952 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
835 aa  142  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
1009 aa  142  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 
784 aa  142  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 
1084 aa  142  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.2 
 
 
1203 aa  142  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
541 aa  142  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.22 
 
 
1350 aa  141  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  24.64 
 
 
783 aa  140  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1313 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
911 aa  140  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1342 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
403 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  24.64 
 
 
783 aa  140  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  24.85 
 
 
770 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 
678 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>