68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0983 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  30.99 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  32.86 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.07 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  28.06 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30.99 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  29.58 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.37 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.2 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  29.79 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.51 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  27.7 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  30.94 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  35.48 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  30.41 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  28.47 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  29.2 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  31.45 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  27.13 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  25.5 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  28.91 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  28.12 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  30.56 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  31.5 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  28.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.13 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  27.86 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  28.12 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  28.8 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  27.97 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  29.69 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  27.56 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  30 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  28.89 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  27.27 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  25.93 
 
 		 405 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  29.69 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  29.46 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  30.16 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  29.46 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  28.28 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  29.46 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  30.08 
 
 		 134 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  28.57 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  28.57 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  30.77 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  32.94 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  25.95 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  27.69 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  29.1 
 
 		 281 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2130  DoxX family protein  29.41 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354782  normal  0.37108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  29.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  29.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  29.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  29.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  27.87 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  29.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  27.27 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  29.41 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  29.41 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  29.1 
 
 		 281 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  28.93 
 
 		 130 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  27.87 
 
 		 738 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  27.87 
 
 		 738 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>