More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0853 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  52.06 
 
 		 344 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 345 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 		 333 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 343 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 337 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 342 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 		 343 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 342 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  36.98 
 
 		 347 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 344 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 353 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 348 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 353 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 336 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.95 
 
 		 353 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  36.98 
 
 		 347 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 353 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 333 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 353 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 359 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 340 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 333 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 330 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 337 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 353 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 337 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 336 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 330 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2197  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 336 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.536448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 362 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 337 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  35.48 
 
 		 348 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 337 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 382 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  37.77 
 
 		 366 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 334 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 331 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 336 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  36.65 
 
 		 335 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 361 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 339 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 340 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 346 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  37.82 
 
 		 352 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  38.92 
 
 		 347 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 327 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 346 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 		 348 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  33.5 
 
 		 336 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 339 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 366 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 374 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  37.43 
 
 		 333 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 358 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 358 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  31.77 
 
 		 338 aa  98.6  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  32.11 
 
 		 360 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 400 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 376 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 341 aa  97.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 339 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 364 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 351 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 366 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  39.02 
 
 		 330 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 364 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 366 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 343 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 341 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 341 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 364 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 334 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 346 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 358 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  35.75 
 
 		 330 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 336 aa  95.5  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 341 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 344 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 338 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 357 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 366 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 334 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  34.52 
 
 		 387 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 		 350 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 347 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 339 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  34.07 
 
 		 339 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 334 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>