More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0719 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
401 aa  828    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  39.8 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
394 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 
392 aa  252  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
391 aa  252  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
410 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  37.18 
 
 
384 aa  249  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  38.68 
 
 
390 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
393 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
387 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
414 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
435 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
403 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
409 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
404 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.36 
 
 
401 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
415 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
403 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
403 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
402 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  27.58 
 
 
401 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
418 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
386 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
426 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
424 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
424 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
423 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  27.91 
 
 
413 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
434 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
434 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
419 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
413 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
445 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
353 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
422 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
422 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
424 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
447 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
420 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
443 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
440 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
421 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0848  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.34 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.46 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.56 
 
 
778 aa  80.5  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
733 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  28.17 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.78 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>