More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0654 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  100 
 
 		 438 aa  903    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  37.56 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  39.12 
 
 		 468 aa  275  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  38.3 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  38.52 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  36.49 
 
 		 428 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  36.85 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  37.12 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  37.41 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  38.06 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  35.38 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  36.19 
 
 		 413 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  36.34 
 
 		 414 aa  196  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  36.67 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.64 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  34.8 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.91 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  34.06 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  35.34 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  32.14 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  35.28 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  32.46 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  31.35 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  30.99 
 
 		 448 aa  170  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  31.13 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  28.47 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  33.73 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  31.51 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  33.71 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.88 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  26.87 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  26.69 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  25.85 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  42.86 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  26.52 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  42.11 
 
 		 599 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  46.25 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  56.36 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.28 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  23.95 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  43.24 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.44 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  24.92 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  27.05 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  45.45 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  30.22 
 
 		 470 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.42 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  52.73 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  26.94 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  57.14 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  26.94 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.02 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  26.94 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  46.15 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  50 
 
 		 498 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.96 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  27.98 
 
 		 488 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  41.89 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  36.96 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  31.43 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  46.15 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  36.96 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  29.12 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  26.26 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  23.3 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  28.65 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  36.96 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  27.34 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  30.48 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  31.43 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  36.96 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  49.06 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  57.78 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  29.83 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.08 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  41.67 
 
 		 552 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  45.61 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.08 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.96 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  43.84 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  45.76 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  58.33 
 
 		 520 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  36.96 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  24.91 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  28.29 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.08 
 
 		 487 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>