279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0624 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  100 
 
 		 894 aa  1851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  37.33 
 
 		 862 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  34.67 
 
 		 707 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  35.17 
 
 		 704 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 		 803 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  32.7 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  29.59 
 
 		 824 aa  295  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  30.95 
 
 		 897 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 888 aa  280  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  29.33 
 
 		 848 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.14 
 
 		 858 aa  256  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 		 979 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.92 
 
 		 785 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 806 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.67 
 
 		 805 aa  214  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28.29 
 
 		 928 aa  207  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.05 
 
 		 750 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 781 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  29.7 
 
 		 558 aa  202  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  27.91 
 
 		 1015 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.59 
 
 		 805 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.15 
 
 		 781 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 766 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 984 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.92 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 925 aa  191  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 754 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.33 
 
 		 913 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.82 
 
 		 1171 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.1 
 
 		 1355 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  29.18 
 
 		 763 aa  184  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30 
 
 		 794 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 873 aa  181  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 832 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.54 
 
 		 815 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 		 986 aa  178  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.5 
 
 		 644 aa  176  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  26.5 
 
 		 601 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 827 aa  175  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.5 
 
 		 811 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.8 
 
 		 563 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.03 
 
 		 787 aa  173  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.66 
 
 		 813 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 598 aa  171  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 932 aa  171  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 1175 aa  171  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  29.69 
 
 		 804 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 		 807 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.39 
 
 		 564 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.67 
 
 		 590 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 		 806 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.81 
 
 		 748 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 825 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  23.93 
 
 		 859 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  29.58 
 
 		 804 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.24 
 
 		 603 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.29 
 
 		 837 aa  165  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.71 
 
 		 670 aa  164  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  26.83 
 
 		 964 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.06 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.66 
 
 		 591 aa  162  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.29 
 
 		 747 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.85 
 
 		 607 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.83 
 
 		 686 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.95 
 
 		 922 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  25.47 
 
 		 577 aa  158  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 799 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.36 
 
 		 903 aa  157  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.23 
 
 		 920 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 829 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.29 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  28.9 
 
 		 625 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  27.2 
 
 		 603 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.31 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 919 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  28.4 
 
 		 604 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  27.2 
 
 		 603 aa  149  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  27.03 
 
 		 603 aa  149  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  27.2 
 
 		 603 aa  149  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.55 
 
 		 598 aa  148  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  27.03 
 
 		 603 aa  148  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  27.03 
 
 		 603 aa  148  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.83 
 
 		 603 aa  147  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 1093 aa  146  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.71 
 
 		 824 aa  146  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  27.03 
 
 		 603 aa  145  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  27.03 
 
 		 603 aa  145  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  25.11 
 
 		 961 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.98 
 
 		 600 aa  145  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.88 
 
 		 1781 aa  144  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  24.75 
 
 		 599 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  24.03 
 
 		 588 aa  142  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 655 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 858 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.54 
 
 		 598 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 1185 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.92 
 
 		 1017 aa  138  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  28.3 
 
 		 568 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.47 
 
 		 920 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25.6 
 
 		 597 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>