161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0594 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  57.42 
 
 		 1052 aa  1231    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  45.94 
 
 		 1068 aa  901    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 1053 aa  2135    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  51.46 
 
 		 1066 aa  1059    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  53.57 
 
 		 1067 aa  1147    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  51.21 
 
 		 1071 aa  1074    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1074 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1071 aa  230  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1129 aa  225  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.48 
 
 		 1125 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  25.77 
 
 		 1041 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1097 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1077 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1105 aa  174  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 1100 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1123 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1074 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.48 
 
 		 1081 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25.15 
 
 		 1056 aa  132  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.67 
 
 		 1066 aa  131  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  29.48 
 
 		 1116 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  21.89 
 
 		 1051 aa  119  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1065 aa  118  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1075 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  26.27 
 
 		 986 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  22.11 
 
 		 1061 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1075 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1125 aa  115  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1176 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1232 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  21.42 
 
 		 1057 aa  114  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1196 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1041 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1105 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.3 
 
 		 1068 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.39 
 
 		 1008 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1173 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1257 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1008 aa  102  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 1167 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  22.76 
 
 		 1195 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1008 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  29.63 
 
 		 1203 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 1153 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1069 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1206 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1016 aa  99  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1162 aa  99  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  28 
 
 		 511 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1123 aa  98.2  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1149 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.88 
 
 		 1162 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1126 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.38 
 
 		 979 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.09 
 
 		 1194 aa  93.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  29.56 
 
 		 1010 aa  92.8  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1114 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1120 aa  91.3  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1122 aa  91.3  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1161 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  28.8 
 
 		 1210 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.1 
 
 		 992 aa  89.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1141 aa  89  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1109 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1026 aa  87.4  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1132 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.25 
 
 		 966 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1105 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 993 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  26.86 
 
 		 1012 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1122 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.66 
 
 		 1001 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.19 
 
 		 1298 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.88 
 
 		 1037 aa  75.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1007 aa  75.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1066 aa  75.5  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 1054 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 1188 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1010 aa  73.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.07 
 
 		 1050 aa  72.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 1007 aa  70.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 991 aa  71.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 1066 aa  68.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 972 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 952 aa  68.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 888 aa  63.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1124 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1064 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1194 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  23.79 
 
 		 997 aa  58.9  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1057 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 791 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 822 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 769 aa  55.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 805 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 817 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>