197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0536 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 393 aa  818    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  74.52 
 
 		 384 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  35.77 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  34.34 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.78 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.28 
 
 		 487 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  31.8 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.76 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.53 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 644 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.16 
 
 		 323 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.98 
 
 		 855 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.32 
 
 		 522 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.95 
 
 		 344 aa  96.3  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 310 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.74 
 
 		 713 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.19 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  27.03 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.07 
 
 		 524 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  31.42 
 
 		 533 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  25.37 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.11 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  28.07 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.33 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  28.51 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  25.75 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 		 829 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.84 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  26.69 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  33.79 
 
 		 1186 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 571 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.61 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.21 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  23.39 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.86 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  26.06 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.41 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.65 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  28.17 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  32.16 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  27.84 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.84 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 505 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 636 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 580 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 		 515 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.29 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  25.89 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  30.73 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  24.84 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.09 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.98 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.79 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.15 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  23.78 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.1 
 
 		 648 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.48 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.13 
 
 		 712 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  30.14 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.48 
 
 		 607 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.56 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.85 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  23.4 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  24.45 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.97 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  24.47 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  22.98 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.02 
 
 		 699 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.36 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.36 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.43 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  28.14 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.37 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.15 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  24.77 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.14 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>