147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0524 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  169  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 87 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  61.9 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  65.06 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  60.24 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  55.42 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  36.26 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  36.05 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.24 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 90 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  34.52 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  38.55 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  41.54 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  34.18 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  36.59 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  34.69 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  36.05 
 
 		 86 aa  43.9  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  31.76 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  34.88 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  35.44 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  37.66 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  32.58 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  31.76 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>