More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0516 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  71.72 
 
 		 864 aa  1300    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 858 aa  691    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 		 871 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  53.89 
 
 		 891 aa  952    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  61.01 
 
 		 863 aa  1092    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  53.12 
 
 		 898 aa  886    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  46.08 
 
 		 872 aa  755    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  44.98 
 
 		 871 aa  744    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 869 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 881 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  62.1 
 
 		 858 aa  1112    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 		 928 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  44.64 
 
 		 878 aa  729    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 868 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.01 
 
 		 900 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 886 aa  1822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 		 873 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 828 aa  645    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 		 870 aa  716    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 882 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  58.03 
 
 		 869 aa  1046    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  46.61 
 
 		 873 aa  757    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 872 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 		 872 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 872 aa  648    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  57.62 
 
 		 855 aa  1025    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 		 862 aa  663    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 896 aa  690    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.39 
 
 		 887 aa  704    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 858 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 894 aa  665    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.66 
 
 		 858 aa  693    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 882 aa  691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 		 932 aa  694    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  44.41 
 
 		 872 aa  722    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 875 aa  759    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 870 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  67.32 
 
 		 856 aa  1203    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 910 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 837 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 891 aa  709    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.62 
 
 		 869 aa  724    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 863 aa  650    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 859 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.06 
 
 		 872 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 867 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  41.81 
 
 		 882 aa  636    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  59.01 
 
 		 868 aa  1068    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  58.23 
 
 		 860 aa  1042    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 		 889 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 		 868 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 		 870 aa  734    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 882 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 910 aa  635  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 868 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 853 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 		 882 aa  628  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 871 aa  626  1e-178  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 863 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 884 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 884 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 823 aa  622  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 859 aa  625  1e-177  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 897 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 882 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 860 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 		 857 aa  620  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 854 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 871 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 855 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 		 872 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 855 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 856 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 855 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 887 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 855 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 		 859 aa  612  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 855 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  38.49 
 
 		 883 aa  612  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 865 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.8 
 
 		 855 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 892 aa  611  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 854 aa  611  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 854 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  39.11 
 
 		 863 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 848 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 873 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 854 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 851 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 		 850 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 852 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 853 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 859 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  39.07 
 
 		 853 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 856 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>