More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0506 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 461 aa  944    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  70.22 
 
 		 455 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  73.81 
 
 		 457 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  63.68 
 
 		 458 aa  631  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  63.2 
 
 		 457 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  62.14 
 
 		 453 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  62.2 
 
 		 453 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  62.14 
 
 		 454 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  60.26 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 461 aa  508  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  52.84 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  50.65 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  53.08 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  51.42 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  52.97 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  51.72 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  51.72 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  52.5 
 
 		 470 aa  455  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50.78 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  52.72 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  48.65 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  48.58 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  47.48 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  46.35 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  48.62 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 507 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  47.72 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  48.39 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  48.14 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 466 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  47.82 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  47.82 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  47.82 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  43.96 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  46.91 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  47.14 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  46.84 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  46.54 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  44.81 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  47.11 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  46.91 
 
 		 467 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  48.53 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  48.53 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  47.34 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  43.7 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  47.72 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  48.21 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  44.07 
 
 		 518 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  43.14 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  50.25 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>