More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0446 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  100 
 
 		 302 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  83.77 
 
 		 292 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  77.67 
 
 		 290 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  70.77 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  66.33 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  59.67 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  61.15 
 
 		 288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  60.85 
 
 		 290 aa  353  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  58.06 
 
 		 299 aa  346  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  55.47 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  53.57 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.35 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  52.86 
 
 		 298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 308 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.72 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.72 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 340 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  298  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  48.23 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  46.86 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.99 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 300 aa  295  9e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.14 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.8 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  48.64 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  48.12 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  50 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  48.46 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  48.46 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  45.51 
 
 		 329 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  47.16 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  45.18 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  45.18 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  45.18 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  48.12 
 
 		 330 aa  281  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  47.44 
 
 		 316 aa  281  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  44.85 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  44.85 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  44.85 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  44.85 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.62 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  44.85 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  46.83 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  44.19 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 322 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  45.64 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  46.26 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 292 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  48 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  43.85 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.46 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.6 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  43.85 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  48.47 
 
 		 535 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>