161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0378 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  100 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  51.35 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  39.73 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  38.51 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  40.3 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  39.73 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  38.35 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  34.93 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  38.51 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  32.64 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  42.75 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  42.14 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  37.96 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  37.14 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  41.18 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  36.64 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  36.67 
 
 
149 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  35.81 
 
 
145 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  34.69 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  38.85 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  36.55 
 
 
177 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  40.34 
 
 
170 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  40.15 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  36.62 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  34.33 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  35.62 
 
 
146 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  31.97 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  35.62 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  38.06 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  39.13 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  35.92 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  31.47 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  38.41 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  39.39 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.62 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  38.69 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  32.41 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  39.69 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  31.41 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  34.06 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  34.85 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.06 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  34.56 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  31.69 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  34.56 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  34.09 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  31.62 
 
 
318 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  34.09 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  35.57 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  32.17 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  32.21 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  36.51 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  37.3 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  32.35 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  43.04 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  42.53 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  33.88 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  34.69 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  33.81 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  33.81 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  30.33 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.95 
 
 
317 aa  67.8  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  36.5 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.08 
 
 
307 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  35.25 
 
 
315 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  35.29 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  28.26 
 
 
297 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  34.07 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  36.89 
 
 
320 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.68 
 
 
309 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.68 
 
 
309 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  31.29 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  31.29 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  36.89 
 
 
313 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  31.3 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  36.89 
 
 
313 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  28.08 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  32.28 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  30.61 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  30.61 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  23.4 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  26.39 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  31.2 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.12 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  25.68 
 
 
147 aa  52  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  29.01 
 
 
160 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1691  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.119542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  27.21 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>