More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0296 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  100 
 
 
97 aa  197  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  68.42 
 
 
99 aa  137  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  55.67 
 
 
102 aa  112  2e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  53.76 
 
 
392 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.69 
 
 
375 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.81 
 
 
395 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  46.32 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.62843e-08  hitchhiker  2.63083e-06 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  47.37 
 
 
105 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  51.61 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  47.78 
 
 
201 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  46.39 
 
 
116 aa  81.6  3e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.14418e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 
102 aa  81.6  3e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  50 
 
 
105 aa  81.3  5e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.32 
 
 
392 aa  80.9  5e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.92 
 
 
393 aa  80.5  8e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 
113 aa  80.1  9e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  48.39 
 
 
145 aa  80.1  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  48.05 
 
 
132 aa  79.7  1e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  47.31 
 
 
269 aa  79  2e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  9.17613e-09 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
123 aa  79.3  2e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  45.26 
 
 
106 aa  79  2e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.88 
 
 
130 aa  79.3  2e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  43.48 
 
 
109 aa  77.4  6e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  43.48 
 
 
109 aa  77.4  6e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 
98 aa  77  7e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.75905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
103 aa  77  8e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
113 aa  76.6  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
123 aa  76.6  1e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.09 
 
 
386 aa  76.3  1e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.92 
 
 
390 aa  75.5  2e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.88 
 
 
393 aa  75.9  2e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.92 
 
 
398 aa  76.3  2e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 
98 aa  75.5  2e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.88 
 
 
390 aa  75.1  3e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
383 aa  74.3  5e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 
98 aa  73.9  7e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
395 aa  73.9  7e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  46.39 
 
 
104 aa  73.9  7e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  47.06 
 
 
377 aa  73.6  8e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  45.16 
 
 
189 aa  73.6  9e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.61 
 
 
173 aa  73.2  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.3 
 
 
568 aa  72.4  2e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.22 
 
 
563 aa  72.4  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.59863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  39 
 
 
184 aa  72.8  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 
558 aa  72.8  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.49 
 
 
564 aa  71.6  3e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  50 
 
 
138 aa  71.2  4e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  45.36 
 
 
98 aa  71.6  4e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.77114e-15 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  45.36 
 
 
98 aa  71.6  4e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.01 
 
 
387 aa  70.9  6e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  44.33 
 
 
98 aa  70.9  6e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  44.33 
 
 
98 aa  70.9  6e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 
137 aa  69.7  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  7.89559e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  43.62 
 
 
106 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25485e-07 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  43.16 
 
 
186 aa  69.7  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  43.16 
 
 
186 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.93639e-08 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
199 aa  69.7  1e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  47.44 
 
 
141 aa  70.1  1e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  43.16 
 
 
186 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47313e-12 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.21 
 
 
386 aa  70.1  1e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
150 aa  68.9  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  44.79 
 
 
101 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.49 
 
 
390 aa  68.9  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
383 aa  68.9  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.36 
 
 
566 aa  68.9  2e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.94 
 
 
189 aa  68.9  2e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  36.19 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  43.16 
 
 
186 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
141 aa  68.2  3e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 
186 aa  68.6  3e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 
186 aa  68.6  3e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  45.16 
 
 
121 aa  68.2  4e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.00861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  42.71 
 
 
101 aa  67.4  6e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.21 
 
 
386 aa  67.4  6e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.94 
 
 
390 aa  67.4  6e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
194 aa  67.4  6e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  42 
 
 
357 aa  67.4  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 
121 aa  67  8e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  43.75 
 
 
101 aa  67  8e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
279 aa  67  8e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.11 
 
 
170 aa  67  9e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
150 aa  66.6  9e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.86 
 
 
390 aa  66.6  9e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  40 
 
 
393 aa  66.2  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.58 
 
 
356 aa  66.6  1e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.58 
 
 
356 aa  66.6  1e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
133 aa  66.6  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
220 aa  66.2  1e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.54 
 
 
389 aa  66.6  1e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  42.22 
 
 
105 aa  66.6  1e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
103 aa  65.9  2e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  9.62456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
116 aa  65.5  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  42.71 
 
 
101 aa  65.5  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  42.71 
 
 
101 aa  65.5  2e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.58 
 
 
356 aa  65.5  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  42.71 
 
 
101 aa  65.5  2e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 
472 aa  65.9  2e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
137 aa  65.5  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  42.71 
 
 
101 aa  65.5  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  42.71 
 
 
101 aa  65.5  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>