More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0267 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
225 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.35 
 
 
219 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.65 
 
 
218 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  39.35 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.79 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.55 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
228 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  37.67 
 
 
456 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  37.67 
 
 
456 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.29 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  36.28 
 
 
456 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.87 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
221 aa  128  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  35.38 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.55 
 
 
232 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.08 
 
 
233 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.09 
 
 
254 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.41 
 
 
231 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.38 
 
 
232 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  37.07 
 
 
241 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  35.38 
 
 
218 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.16 
 
 
233 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 
217 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  34.45 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  35.03 
 
 
221 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  32.86 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
222 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.63 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.64 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  33.68 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.55 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.71 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  32.98 
 
 
221 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
216 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 
218 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 
228 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 
215 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  34.21 
 
 
219 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  33.51 
 
 
218 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  29.49 
 
 
230 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  36.04 
 
 
585 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.99 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 
216 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.82 
 
 
396 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  32.98 
 
 
221 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
231 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
226 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  33.04 
 
 
230 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.36 
 
 
213 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.32 
 
 
226 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.41 
 
 
219 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
232 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.4 
 
 
227 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.24 
 
 
216 aa  99  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.79 
 
 
235 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.54 
 
 
221 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
220 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.79 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  34.04 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  33.91 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  30.91 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  31.98 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  30.85 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.08 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.22 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.9 
 
 
202 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.08 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.96 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.08 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
242 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  31.47 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.78 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  34.64 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.05 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  34.05 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.38 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  32.82 
 
 
219 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  32.8 
 
 
221 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>