74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0265 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  57.66 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  45.99 
 
 
206 aa  171  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  52.6 
 
 
181 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  51.55 
 
 
167 aa  167  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  54.05 
 
 
151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  48.68 
 
 
167 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  50 
 
 
165 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  46.5 
 
 
182 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  47.1 
 
 
155 aa  144  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  47.06 
 
 
178 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  41.67 
 
 
175 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  42.24 
 
 
174 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  49.31 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  40.24 
 
 
177 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  46.2 
 
 
159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  36.99 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  36.99 
 
 
149 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  34.92 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  33.58 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  31.45 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  33.11 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  28.46 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  31.43 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  32.12 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  33.08 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  28.86 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  35.61 
 
 
146 aa  61.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  32.59 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  33.79 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  28.48 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  36 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  28.29 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  32.59 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  30.99 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  32.59 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  29.49 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  32.59 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  30.47 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  31.43 
 
 
155 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  31.72 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  31.13 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  30.28 
 
 
145 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  31.78 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  31.62 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  32.87 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  31.47 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  25.16 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  30.61 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  31.01 
 
 
189 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  30.71 
 
 
262 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  29.66 
 
 
143 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  29.08 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  28.37 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  26.24 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  30.5 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  28.97 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  34.31 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  29.22 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  29.79 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  28.67 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.67 
 
 
310 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  31.4 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  25.85 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  30.43 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>