More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0162 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  100 
 
 		 103 aa  202  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  74.76 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  70 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  60.61 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  63.64 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  55.77 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  53.4 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  54.46 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  53.47 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  59 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  58.16 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  55.34 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  53.92 
 
 		 120 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  51.96 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  52.53 
 
 		 185 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  50.98 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  50.98 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  53 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  48.98 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  52.04 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  50.98 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  52.13 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  51.02 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  49 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  48.98 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  49.48 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  45.54 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  51.04 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  49.49 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  47.42 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  47.42 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  47.42 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  47.47 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  47.47 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  48.04 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  46.94 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  47.47 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  52.69 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  52.69 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  46.46 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  46.94 
 
 		 131 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  46.46 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  48.48 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  48 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  46.46 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  45 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  48.42 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  47.47 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  43.88 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  45.54 
 
 		 180 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  39.05 
 
 		 181 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  44 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  44 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  39.22 
 
 		 181 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  43 
 
 		 185 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  47.47 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  45.83 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  40.19 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  43 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  42.45 
 
 		 182 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.45 
 
 		 182 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  42.45 
 
 		 182 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  42.45 
 
 		 182 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  42.45 
 
 		 174 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  42.45 
 
 		 182 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  42.42 
 
 		 179 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  42 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.1 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  39.42 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  40.57 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  36.79 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  44.33 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  39.05 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  44.33 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42.27 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  47.19 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1565  hypothetical protein  39.36 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000508323  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.51 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  38.68 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  45.16 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  40.38 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>