More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0155 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1153 aa  2360    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 1383 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 1202 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 1140 aa  783    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 		 1010 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 1118 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.74 
 
 		 1514 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.62 
 
 		 1514 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1559 aa  634  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 1299 aa  635  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1287 aa  632  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  40.09 
 
 		 1427 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 1048 aa  628  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 1711 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 1131 aa  621  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 1002 aa  619  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 1426 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 		 1431 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1415 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 1003 aa  605  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 		 1406 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 1631 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.74 
 
 		 1152 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 1385 aa  579  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1390 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1390 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 1361 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 1013 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 1370 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1651 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 1646 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  41.36 
 
 		 919 aa  532  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 1383 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.73 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1248 aa  512  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 		 1645 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 		 767 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  29.6 
 
 		 1816 aa  364  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.14 
 
 		 435 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.74 
 
 		 829 aa  354  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 		 799 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 809 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 		 678 aa  345  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 978 aa  337  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.62 
 
 		 713 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 		 881 aa  336  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 969 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  64.82 
 
 		 520 aa  332  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.86 
 
 		 683 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  59.92 
 
 		 573 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  41.2 
 
 		 1180 aa  303  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2064  histidine kinase  64.52 
 
 		 602 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.84 
 
 		 828 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  40.87 
 
 		 1156 aa  296  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  40.32 
 
 		 1172 aa  294  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  34.51 
 
 		 1614 aa  288  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.98 
 
 		 1060 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 929 aa  281  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 		 550 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 978 aa  267  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 1172 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 568 aa  264  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 911 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  37.59 
 
 		 1093 aa  263  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 		 975 aa  261  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 		 528 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  37.58 
 
 		 1366 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 674 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  37.65 
 
 		 1306 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  34.97 
 
 		 1374 aa  254  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  38.76 
 
 		 1311 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.96 
 
 		 1384 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  51.78 
 
 		 881 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  35.65 
 
 		 1340 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 1029 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  33.92 
 
 		 1373 aa  248  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  36.25 
 
 		 1378 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 526 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.83 
 
 		 1344 aa  246  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.39 
 
 		 1301 aa  244  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  33.12 
 
 		 1418 aa  244  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  47.74 
 
 		 503 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  45 
 
 		 505 aa  242  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  35.83 
 
 		 1343 aa  241  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  33.33 
 
 		 1373 aa  241  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.17 
 
 		 1355 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 1341 aa  240  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  37.58 
 
 		 663 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  50.19 
 
 		 700 aa  240  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  47.48 
 
 		 490 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  34.99 
 
 		 876 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.86 
 
 		 1366 aa  239  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  36.07 
 
 		 1344 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  34.49 
 
 		 1400 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 904 aa  235  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 940 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 		 659 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 660 aa  233  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>