50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0140 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  100 
 
 
379 aa  776  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  46.46 
 
 
379 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  47.32 
 
 
373 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  46.02 
 
 
395 aa  309  6e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  41.82 
 
 
1101 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  38.16 
 
 
377 aa  269  6e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  39.9 
 
 
395 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  40.39 
 
 
387 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  41.41 
 
 
365 aa  262  9e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  39.79 
 
 
381 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  39.68 
 
 
387 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  35.47 
 
 
1852 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  32.64 
 
 
400 aa  142  1e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  31.86 
 
 
417 aa  140  4e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  31.75 
 
 
401 aa  132  7e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  30.36 
 
 
408 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  30.14 
 
 
375 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  28.69 
 
 
383 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.39 
 
 
629 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  29.66 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.52 
 
 
933 aa  87  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.57 
 
 
932 aa  84.7  2e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.35 
 
 
376 aa  77  5e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.48 
 
 
931 aa  73.6  6e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  23.86 
 
 
387 aa  70.5  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  24.46 
 
 
402 aa  69.3  9e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25.14 
 
 
396 aa  67.4  4e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.46 
 
 
396 aa  67  5e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  24.06 
 
 
396 aa  65.5  1e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  29.8 
 
 
391 aa  65.1  2e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  24.35 
 
 
934 aa  63.2  7e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  23.56 
 
 
396 aa  58.9  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  27.03 
 
 
350 aa  57.8  3e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.43325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.98 
 
 
951 aa  57.4  5e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  29.79 
 
 
389 aa  56.6  6e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  28.81 
 
 
412 aa  55.1  2e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  24.86 
 
 
380 aa  54.7  3e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  21.65 
 
 
379 aa  52  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  24.9 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  25.41 
 
 
828 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  21.43 
 
 
828 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  27.87 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  25.5 
 
 
829 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  2.08643e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  27.71 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.65 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  27.27 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  26.46 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  23.94 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  23.29 
 
 
402 aa  42.7  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>