More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0121 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3606  Integrase catalytic region  100 
 
 
296 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.607148  normal  0.464703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0121  Integrase catalytic region  100 
 
 
296 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.133865 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0907  hypothetical protein  38.32 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.129322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2305  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2322  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2538  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2543  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.66662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3282  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3616  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623874  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3056  IS3 family transposase  41.6 
 
 
246 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6760  Integrase catalytic region  40.36 
 
 
305 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4443  Integrase catalytic region  38.98 
 
 
256 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1881  Integrase catalytic region  38.98 
 
 
256 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  36.3 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  36.3 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  36.3 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  40.09 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  40.09 
 
 
240 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  40.09 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  40.09 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  40.09 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  40.09 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  36.3 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  36.3 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  36.3 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  36.9 
 
 
405 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  36.9 
 
 
405 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  36.9 
 
 
405 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  36.9 
 
 
405 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  36.9 
 
 
405 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  36.9 
 
 
405 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  35.93 
 
 
275 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  39.23 
 
 
267 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  35.93 
 
 
275 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  34.94 
 
 
411 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  34.94 
 
 
411 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  34.94 
 
 
411 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  34.94 
 
 
411 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  34.94 
 
 
411 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  36.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  36.19 
 
 
266 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
265 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
265 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
265 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
265 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  38.85 
 
 
267 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  36.02 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  36.02 
 
 
263 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  38.85 
 
 
267 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  38.08 
 
 
267 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0092  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  38.08 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  38.08 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  38.08 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  38.08 
 
 
267 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  37.27 
 
 
409 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_002950  PG0943  ISPg5, transposase Orf2  35.64 
 
 
312 aa  155  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0331462 
 
 
-
 
NC_002950  PG1420  ISPg5, transposase Orf2  35.64 
 
 
312 aa  155  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  36.84 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  35.25 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_002950  PG2057  ISPg5, transposase Orf2  35.27 
 
 
312 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  38.28 
 
 
269 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  36.88 
 
 
272 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0008  ISPg5 transposase Orf2  35.27 
 
 
312 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0403469 
 
 
-
 
NC_002950  PG0041  ISPg5 transposase Orf2  35.27 
 
 
312 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0426  ISPg5, transposase Orf2  35.27 
 
 
312 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0458  ISPg5, transposase Orf2  35.27 
 
 
312 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0591  ISPg5, transposase Orf2  34.8 
 
 
312 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2128  ISPg5, transposase Orf2  35.27 
 
 
312 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1644  ISPg5, transposase Orf2  34.8 
 
 
312 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 
240 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 
240 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 
240 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  39 
 
 
239 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  38.96 
 
 
242 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  38.96 
 
 
242 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>