99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0103 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  100 
 
 		 367 aa  749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  33.22 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  29.73 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  29.71 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  25.08 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  25.19 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.67 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  27.53 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  26.8 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  28.45 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  28.33 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  28.83 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  28.02 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  28.02 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.5 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  28.19 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  28.19 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  24.71 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  24.7 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 593 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  24.32 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  27.47 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  24.46 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  25.76 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  24.84 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.25 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.25 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.25 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  23.11 
 
 		 518 aa  50.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  23.69 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 615 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  27.21 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  28.1 
 
 		 6999 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 453 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 586 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 563 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 		 562 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  22.4 
 
 		 427 aa  49.7  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  31.82 
 
 		 584 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  21.23 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.5 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  22.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  26.67 
 
 		 591 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  24.12 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  22.82 
 
 		 998 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 500 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 568 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2300  acyl-CoA synthetase  24.15 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.6 
 
 		 518 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  22.48 
 
 		 998 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  23.96 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.65 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  32.35 
 
 		 1344 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  20.86 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  31.86 
 
 		 590 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  23.78 
 
 		 6404 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  31.86 
 
 		 590 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  20.89 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  20.83 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  28.31 
 
 		 3962 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  23.83 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4195  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 		 561 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  35.37 
 
 		 500 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 504 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 		 991 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  24.24 
 
 		 7168 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  20.83 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  20.83 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  20.83 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4394  acyl-CoA synthetase  22.42 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.68 
 
 		 5929 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  27.68 
 
 		 2571 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.06 
 
 		 5926 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  27.68 
 
 		 2571 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 563 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  23.21 
 
 		 553 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.29 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 533 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 518 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 533 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  31.6 
 
 		 609 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.27 
 
 		 562 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  28.21 
 
 		 524 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.85 
 
 		 509 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2630  acyl-CoA synthetase  23.51 
 
 		 421 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  20.7 
 
 		 412 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  38.24 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>