141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0045 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  28.78 
 
 
317 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  24.39 
 
 
308 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  30.5 
 
 
331 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  28.52 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  29.39 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  29.04 
 
 
345 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  28.79 
 
 
329 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  35.2 
 
 
310 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  40.34 
 
 
141 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  34.15 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  34.15 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  34.15 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  26.57 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  29.43 
 
 
292 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  33.54 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  28.28 
 
 
300 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  29.08 
 
 
292 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  29.08 
 
 
292 aa  94  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  29.08 
 
 
292 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  29.08 
 
 
292 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  31.55 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  28.72 
 
 
292 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  28.72 
 
 
292 aa  92.4  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  30.99 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  33.54 
 
 
314 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  31.55 
 
 
321 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  28.72 
 
 
292 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  27.82 
 
 
311 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  27.97 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  31.55 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  27.97 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  30.95 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  25.89 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  27.62 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  27.62 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  26.35 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  27.62 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  30.37 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  28.37 
 
 
292 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  25.87 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  27.6 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  24.77 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  26.15 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  27.11 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  27.09 
 
 
298 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  28.08 
 
 
312 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  25.95 
 
 
307 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  27.56 
 
 
307 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  24.46 
 
 
304 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  25.75 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  31.06 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  25.75 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  25.75 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  27.27 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  25.75 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  25.17 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  26.76 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  24.16 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  24.16 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  26.69 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  24.16 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  23.76 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  25.75 
 
 
300 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  25.75 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  23.66 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  25.52 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  28.74 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  23.91 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  24.77 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  24.02 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  25.5 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  25.45 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  26.13 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  25.29 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  27.78 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  26.07 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  26.07 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  24.57 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  25.2 
 
 
298 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  24.84 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  26.9 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  25.5 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  26.17 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  26.17 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  26.17 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  25.94 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  29.31 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  25.15 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  24.53 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  29.63 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  22.51 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  25.43 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1398  putative transposase  29.52 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  24.29 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  26.16 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  25.67 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  26 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  25.67 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  26.76 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>