More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  67.31 
 
 		 106 aa  157  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  65.14 
 
 		 109 aa  155  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  58.88 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  56.36 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  56.31 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  58.1 
 
 		 108 aa  136  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  50.96 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  53.21 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  56 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  56 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  123  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52.53 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  52.88 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  46.79 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  50.46 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  54 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  49.55 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  52.48 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  53.33 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  51.55 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  51.46 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48.6 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  46.3 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  51.46 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  51 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  52.48 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  51.92 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  49.02 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.35 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  54 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52.43 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54.35 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54.35 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54.35 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  52.43 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  48.6 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  48.54 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  48.54 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  48.54 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  50.98 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.15 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  49.51 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  49.51 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  51 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  49.51 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  50.49 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  49.53 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>