179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  100 
 
 
338 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  57.27 
 
 
332 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  56.47 
 
 
335 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  56.47 
 
 
335 aa  363  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  56.47 
 
 
335 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  54.71 
 
 
330 aa  350  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  53.19 
 
 
331 aa  342  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  54.9 
 
 
412 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  46.1 
 
 
318 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
624 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  44.63 
 
 
311 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  48.23 
 
 
624 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  44.82 
 
 
334 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  48.49 
 
 
613 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  45.82 
 
 
343 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  45.48 
 
 
343 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  45.39 
 
 
310 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  45.07 
 
 
310 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  45.39 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  45.39 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  44.74 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  43.18 
 
 
310 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  44.74 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  45.39 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  45.39 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  45.39 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  48.78 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  42.9 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  41.94 
 
 
313 aa  256  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  44.7 
 
 
425 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  46.71 
 
 
306 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  46.23 
 
 
620 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  44.15 
 
 
601 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  46.15 
 
 
422 aa  248  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  42.14 
 
 
343 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  45.61 
 
 
418 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  45.72 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  40.66 
 
 
608 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  41 
 
 
483 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  38.82 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  38.82 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  39.04 
 
 
307 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  38.24 
 
 
307 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  42.47 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  38.24 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  40.52 
 
 
456 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  37.17 
 
 
307 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  37.38 
 
 
308 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  36.39 
 
 
326 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  36.39 
 
 
326 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  36.47 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  36.07 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  36.07 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  36.07 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  36.07 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  36.07 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  35.88 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  40.59 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  35.9 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  40.13 
 
 
309 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  36.42 
 
 
304 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  36.42 
 
 
304 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  38.06 
 
 
306 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  37.41 
 
 
304 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  37.41 
 
 
304 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  36.09 
 
 
304 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  37.06 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  40.92 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  35.18 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  39.87 
 
 
309 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  39.6 
 
 
309 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  36.63 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  36.63 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  36.63 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  36.63 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  36.63 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  36.63 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  39.22 
 
 
311 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  37.87 
 
 
311 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  36.09 
 
 
309 aa  185  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  37.54 
 
 
309 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  34.1 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  33.77 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  39.22 
 
 
306 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  35.97 
 
 
346 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  38.31 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  34.53 
 
 
306 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  38.01 
 
 
308 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  36.01 
 
 
304 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  39.56 
 
 
308 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  38.28 
 
 
309 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>