More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 374 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  52.41 
 
 		 357 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  54.3 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  52.9 
 
 		 351 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  52.48 
 
 		 350 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  53.07 
 
 		 334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  51.72 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  56.35 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  53.31 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  56.74 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  57.28 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  49.72 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  61.64 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  48.09 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  50.16 
 
 		 341 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  50.61 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.44 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  54.52 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  50.49 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  53.4 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.4 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.4 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.4 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  53.4 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.07 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.07 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  53.07 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  52.75 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  53.07 
 
 		 334 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  55.88 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  51.24 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  54.66 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  47.6 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  51.96 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  51.96 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  52.29 
 
 		 335 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  51.96 
 
 		 335 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  51.96 
 
 		 335 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  54.71 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  47.22 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  55.16 
 
 		 363 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  48.18 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  54.9 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  54.37 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  48.06 
 
 		 351 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  49.72 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  50.58 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  50.48 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  54.25 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  43.95 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  42.73 
 
 		 335 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  37.27 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  45.59 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  37.27 
 
 		 340 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 334 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  36.97 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  36.97 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  45.31 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  55.67 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  40.19 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  37.88 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  40.19 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  48.62 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  39.8 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  37.65 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 		 334 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 		 334 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  47.62 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.97 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  43.3 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  41.04 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.86 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  42.94 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  53.99 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  43.61 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  45.52 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  40.3 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  50.9 
 
 		 354 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  52.35 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  41.36 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.73 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  46.45 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  44.95 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  45.95 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  45.28 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  40.76 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  45.69 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.57 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3415  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.533085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  48.55 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  44.04 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  41.29 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  40.45 
 
 		 329 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  45.25 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.22 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26540  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.06 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  38.87 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  40.13 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>