More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
241 aa  467  1e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  65.27 
 
 
239 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  59.57 
 
 
234 aa  245  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
241 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 
235 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
232 aa  182  4e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
276 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 
234 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  44.87 
 
 
234 aa  172  6e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  46.02 
 
 
227 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 
233 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.85 
 
 
235 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 
234 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  47.32 
 
 
234 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
242 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
237 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 
234 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
237 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
237 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 
258 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
233 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 
234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  46.05 
 
 
234 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  46.05 
 
 
234 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  44.84 
 
 
232 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  46.05 
 
 
234 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  45.18 
 
 
234 aa  152  6e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 
243 aa  152  6e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 
244 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.19132e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 
234 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 
234 aa  147  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  42.99 
 
 
245 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  46.82 
 
 
332 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 
228 aa  145  4e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
228 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
228 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  39.64 
 
 
256 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
245 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
237 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  42.67 
 
 
238 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
235 aa  139  4e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
235 aa  139  4e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  41.81 
 
 
231 aa  134  1e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
243 aa  127  2e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
237 aa  127  2e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
239 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
237 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
237 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
237 aa  118  1e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
244 aa  116  4e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
235 aa  114  1e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
247 aa  114  1e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
265 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  33.18 
 
 
244 aa  111  1e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 
243 aa  110  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  40.1 
 
 
279 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
278 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0773345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
281 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
317 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10875  short chain dehydrogenase/reductase (Ayr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04530)  36.63 
 
 
297 aa  92.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  91.7  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
279 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.25 
 
 
304 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
284 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
279 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
244 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23251e-09 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
231 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
300 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
257 aa  85.1  1e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
279 aa  84.7  1e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
293 aa  84.7  1e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
292 aa  84  2e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
284 aa  83.6  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
243 aa  84.3  2e-15  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
276 aa  83.6  3e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
257 aa  83.2  3e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
285 aa  83.2  3e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
279 aa  83.6  3e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
258 aa  83.6  3e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
245 aa  83.2  3e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.73 
 
 
272 aa  83.2  4e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
338 aa  82.8  4e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
287 aa  83.2  4e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
272 aa  82.8  4e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
268 aa  82.8  5e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>