More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 
239 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  65.27 
 
 
241 aa  268  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.53 
 
 
241 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  50.44 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
232 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
276 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.69 
 
 
235 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  46.08 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
242 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.29 
 
 
233 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  46.58 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
245 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
243 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  46.85 
 
 
231 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 
234 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 
234 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 
234 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 
234 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  45.09 
 
 
234 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  37.5 
 
 
256 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  45.33 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 
228 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
243 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
237 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 
234 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 
245 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 
234 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 
228 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 
228 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  40.72 
 
 
233 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
234 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
235 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
235 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  41.59 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
234 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
237 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
237 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 
234 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  45 
 
 
332 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
237 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
238 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 
237 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  37.32 
 
 
279 aa  98.2  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  38.12 
 
 
304 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
267 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  38.38 
 
 
282 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 
272 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10875  short chain dehydrogenase/reductase (Ayr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04530)  39.46 
 
 
297 aa  88.6  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
291 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  32.07 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.398353 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09127  short-chain oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13950)  36.26 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
300 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
314 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
274 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  36.9 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54648  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  28.7 
 
 
297 aa  82  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.329924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>