More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  69.83 
 
 		 538 aa  654    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  73.88 
 
 		 543 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 540 aa  1033    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  59.7 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  46.93 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.44 
 
 		 538 aa  356  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  60.83 
 
 		 562 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 		 545 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  55.74 
 
 		 533 aa  346  7e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 		 538 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.7 
 
 		 528 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  59.47 
 
 		 531 aa  324  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.48 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 		 623 aa  319  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  46.59 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  46.68 
 
 		 530 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  45 
 
 		 540 aa  316  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 		 542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.41 
 
 		 546 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.96 
 
 		 522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  53.94 
 
 		 407 aa  302  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.92 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 		 535 aa  293  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.88 
 
 		 347 aa  290  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.88 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.98 
 
 		 394 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 532 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  54.12 
 
 		 542 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.92 
 
 		 523 aa  279  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.19 
 
 		 544 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 		 526 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  55.24 
 
 		 540 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.52 
 
 		 535 aa  269  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 		 538 aa  269  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 		 904 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.98 
 
 		 547 aa  264  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.78 
 
 		 545 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  54.43 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 		 545 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 		 550 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  52.74 
 
 		 583 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 		 531 aa  247  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 		 1150 aa  244  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 		 529 aa  243  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.21 
 
 		 858 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 		 536 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.06 
 
 		 524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.42 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 		 702 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 		 397 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 540 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 563 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.03 
 
 		 535 aa  209  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 562 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  55.16 
 
 		 965 aa  206  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 563 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 		 715 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 566 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.28 
 
 		 566 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 686 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 731 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 		 656 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 563 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.1 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 		 657 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.1 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 672 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 564 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 741 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  38.55 
 
 		 688 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.91 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.28 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 565 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 572 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 566 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 730 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  30.94 
 
 		 541 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 		 559 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 562 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 563 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 		 674 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 673 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 561 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 		 688 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  38.52 
 
 		 565 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>