More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  73.88 
 
 		 540 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  69.65 
 
 		 538 aa  648    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 543 aa  1035    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  58.79 
 
 		 518 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.18 
 
 		 538 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  48.81 
 
 		 533 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  51.88 
 
 		 533 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 		 538 aa  335  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  58.28 
 
 		 562 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 		 545 aa  334  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.58 
 
 		 537 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  45.77 
 
 		 540 aa  329  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  45.62 
 
 		 540 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.66 
 
 		 545 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.66 
 
 		 528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.72 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  50.46 
 
 		 531 aa  306  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 		 623 aa  300  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.2 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 		 522 aa  292  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  52.85 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  58.72 
 
 		 530 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.2 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.63 
 
 		 538 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  54.71 
 
 		 542 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 		 523 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.37 
 
 		 544 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 		 347 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.25 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  54.46 
 
 		 540 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.83 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.02 
 
 		 904 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  54.43 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.67 
 
 		 547 aa  259  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.65 
 
 		 529 aa  257  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  47.42 
 
 		 583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 		 545 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 		 526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.26 
 
 		 858 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.91 
 
 		 538 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.36 
 
 		 536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.97 
 
 		 1150 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 		 524 aa  230  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.43 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 		 702 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 		 565 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 		 715 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 686 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 563 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 566 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 674 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  45.4 
 
 		 533 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 540 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.63 
 
 		 673 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.84 
 
 		 676 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 		 688 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 688 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  31.08 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 730 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 		 965 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 		 656 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 		 572 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 730 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.48 
 
 		 656 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 741 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.9 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 		 656 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 		 535 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 		 670 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 563 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 563 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 		 672 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.38 
 
 		 560 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 563 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 		 674 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 		 688 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 		 657 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.50218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>