15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36560  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000556158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0201  hypothetical protein  70.39 
 
 		 324 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.292732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0926  hypothetical protein  68.15 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.619837  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18050  hypothetical protein  57.23 
 
 		 320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.225388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2410  hypothetical protein  49.55 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2155  hypothetical protein  47.45 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2742  hypothetical protein  48.77 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2845  hypothetical protein  49.09 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000017407  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0438  hypothetical protein  50.61 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.603444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3753  hypothetical protein  46.63 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3559  hypothetical protein  37.69 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.508417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1274  nitrogenase subunit NifH (ATPase)-like protein  22.95 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0248  hypothetical protein  57.81 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1312  hypothetical protein  23.8 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1445  hypothetical protein  23.16 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000261695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>