54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  100 
 
 
484 aa  946    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  60.53 
 
 
406 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  49.88 
 
 
422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  44.27 
 
 
484 aa  312  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  45.91 
 
 
499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  50 
 
 
386 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  44 
 
 
428 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  52.6 
 
 
416 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  45.14 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  46.58 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  49.42 
 
 
563 aa  228  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  37.23 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  38.76 
 
 
513 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  37.94 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  42.18 
 
 
599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  37.62 
 
 
411 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  38.54 
 
 
447 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  43.5 
 
 
413 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  36.92 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  37.4 
 
 
449 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  38.38 
 
 
404 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  46.46 
 
 
480 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  48.62 
 
 
410 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  49.01 
 
 
424 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  49.01 
 
 
424 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  35.03 
 
 
404 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  36.25 
 
 
393 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  35 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  34.68 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  34.57 
 
 
392 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  33.84 
 
 
345 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  31.98 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  32.39 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  29.96 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  29.55 
 
 
373 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  29.96 
 
 
404 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  27.52 
 
 
434 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  25.3 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  26.59 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  26.77 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  28.73 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  28.73 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  30 
 
 
376 aa  90.5  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  26.27 
 
 
261 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  30.49 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  29.44 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  27 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  23.35 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  27.46 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  27.05 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  29.1 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  29.1 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  24.34 
 
 
253 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  21.46 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>