65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36060  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 347 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000389625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2493  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.64 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336213  normal  0.207047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  33.99 
 
 		 526 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  34.01 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  33.01 
 
 		 558 aa  106  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  33.99 
 
 		 607 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  33.01 
 
 		 567 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.68 
 
 		 571 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.02 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.23 
 
 		 594 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.68 
 
 		 554 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.68 
 
 		 554 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.88 
 
 		 528 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.68 
 
 		 554 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.67 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  32.25 
 
 		 510 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.67 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  31.53 
 
 		 577 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4370  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  33.77 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 569 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.65 
 
 		 516 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.99 
 
 		 527 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  32.65 
 
 		 526 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.99 
 
 		 516 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  32.25 
 
 		 565 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 604 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1543  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.12 
 
 		 263 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741801  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.03 
 
 		 607 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 563 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  29.62 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4013  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.47 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271917  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2488  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.63 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000908937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.05 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3253  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  38.76 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.86 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.04 
 
 		 505 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.81 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000446843  decreased coverage  0.00117344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2766  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0214006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.13 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.21 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.97 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.78 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  25.16 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  25.08 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.84 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.3 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.46 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.47 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  25.51 
 
 		 515 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.21 
 
 		 511 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.84 
 
 		 504 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15180  uroporphyrinogen-III synthase  42.11 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.63 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44610  uroporphyrinogen-iii synthase  39.6 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  23.58 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.14 
 
 		 509 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.07 
 
 		 266 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26800  uroporphyrinogen-III synthase  35.77 
 
 		 260 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.12 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  21.27 
 
 		 516 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  31.41 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.14 
 
 		 507 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 512 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  30.32 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  30.32 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>