More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  100 
 
 
367 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  66.94 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  68.98 
 
 
359 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  63.06 
 
 
362 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  62.33 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  56.25 
 
 
370 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  54.02 
 
 
356 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  52.56 
 
 
391 aa  348  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  52.04 
 
 
372 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  52.49 
 
 
352 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  55.43 
 
 
356 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  50.41 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  52.49 
 
 
376 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  47.67 
 
 
365 aa  327  3e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  50.82 
 
 
366 aa  322  9.000000000000001e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  50.97 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  49.59 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  53.31 
 
 
351 aa  319  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  50.82 
 
 
355 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 
369 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  47.81 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  49.18 
 
 
363 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  47.81 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  50.56 
 
 
355 aa  311  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  50.14 
 
 
369 aa  311  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  47.54 
 
 
358 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  51.83 
 
 
353 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
359 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  48.89 
 
 
351 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  51.35 
 
 
359 aa  308  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  48.11 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  48.89 
 
 
360 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  47.27 
 
 
360 aa  282  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  47.98 
 
 
370 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  47.93 
 
 
356 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  45.67 
 
 
365 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  49.16 
 
 
367 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  48.32 
 
 
367 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  41.13 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  38.03 
 
 
353 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  38.03 
 
 
353 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
373 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  37.85 
 
 
353 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 
370 aa  202  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
374 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  39.95 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  35.07 
 
 
372 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
371 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
369 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  41.12 
 
 
333 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  36.75 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
370 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 
367 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  34.47 
 
 
386 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
371 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  38.52 
 
 
369 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  39.1 
 
 
351 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
370 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  40.6 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.83 
 
 
369 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 
369 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1355  aminotransferase, class I and II  38.2 
 
 
343 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
392 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
370 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
366 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
370 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
352 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
366 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
352 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
366 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
379 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 
370 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 
362 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
366 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 
367 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
374 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
374 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  37.63 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>