46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  46.03 
 
 
253 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  37.14 
 
 
252 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 
264 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  37.14 
 
 
256 aa  148  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 
257 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
281 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
256 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
264 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 
247 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  33.76 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  32.94 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  36.14 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 
324 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
295 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  36.42 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  34 
 
 
243 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  32.8 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  28.35 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  33.61 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  23.92 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  26.41 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  23.92 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  23.53 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  24.14 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  23.14 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  25.58 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  23.14 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  32.79 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  23.14 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  30.27 
 
 
219 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  25.2 
 
 
140 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06066  hypothetical protein  30 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
244 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>