More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  100 
 
 		 381 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  55.67 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  50.26 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  54.41 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  49.22 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  48.96 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  52.99 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  48.02 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  47.4 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  46.88 
 
 		 321 aa  289  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  47.89 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  46.21 
 
 		 343 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  45.74 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  50.15 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  50.15 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  50.15 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  44.27 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  47.48 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  42.58 
 
 		 363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  44.77 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  45.21 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  47.2 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  39.73 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  40.58 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  45.21 
 
 		 319 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  42.55 
 
 		 301 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  39.01 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  38.46 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  36.72 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  34.55 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  34.55 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  34.55 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  37.87 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  34.24 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  34.55 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  35.06 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  33.64 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  40.57 
 
 		 294 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  32.74 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  42.14 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  39.29 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.43 
 
 		 291 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  40.71 
 
 		 305 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  40.6 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  40.71 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  40.2 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  37.31 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  36.56 
 
 		 307 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  39.36 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  39.36 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  40.07 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  39.09 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  36.2 
 
 		 307 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  38.44 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  38.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  38.76 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  39.15 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  37 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  42.2 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  39.29 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  38.35 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  39.01 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  39.21 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  39.64 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  39.29 
 
 		 306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  38.76 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  38.76 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  38.93 
 
 		 305 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  39.93 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  40.57 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  42.35 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  37.67 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  40.89 
 
 		 293 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  38.57 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  40.57 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  40.52 
 
 		 293 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  39.78 
 
 		 293 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  40.52 
 
 		 293 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  37.37 
 
 		 313 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  35.71 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  34.83 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  38.35 
 
 		 289 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  35.64 
 
 		 311 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  37.5 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  39.71 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  34.77 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  38.35 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  36.88 
 
 		 298 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  41.99 
 
 		 307 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  36.56 
 
 		 306 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  36.53 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  36.67 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  33.1 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  35.13 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  37.28 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  35.36 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>