More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  75.29 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  69.96 
 
 		 264 aa  384  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  64.93 
 
 		 294 aa  361  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  65.78 
 
 		 266 aa  358  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  65.65 
 
 		 263 aa  358  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  64.18 
 
 		 268 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  59.18 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  63.6 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  63.98 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  63.64 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  61.22 
 
 		 264 aa  341  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  60 
 
 		 291 aa  328  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  60.07 
 
 		 281 aa  327  8e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  59.56 
 
 		 272 aa  324  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  62.88 
 
 		 266 aa  325  7e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  59.63 
 
 		 272 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  59.02 
 
 		 262 aa  318  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  57.82 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  57.3 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  57.3 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  56.93 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  56.77 
 
 		 262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  52.87 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  50.77 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  52.45 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  51.32 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  48.66 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  46.98 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  45.28 
 
 		 293 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  46.59 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  46.59 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  44.91 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  40.61 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  41.13 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.05 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41.67 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  39.62 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  42.11 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  41.73 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  40.38 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.73 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.73 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  41.51 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  41.35 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  39.08 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.85 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 		 258 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  36.57 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  39.63 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  39.26 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  39.02 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  39.39 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.06 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  40.54 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  38.38 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  37.26 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  37.55 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  36.78 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.33 
 
 		 281 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.09 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 279 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  39.18 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  37.12 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  39.49 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  36.94 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  39.85 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  38.02 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  38.87 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>