37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_34170  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3092  hypothetical protein  74.8 
 
 
123 aa  170  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2358  hypothetical protein  67.48 
 
 
128 aa  164  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.146977  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2910  hypothetical protein  70.4 
 
 
125 aa  160  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3190  hypothetical protein  57.85 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37920  hypothetical protein  57.72 
 
 
126 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3525  hypothetical protein  56.69 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2746  hypothetical protein  68.32 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08930  hypothetical protein  56.35 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4042  hypothetical protein  56.56 
 
 
130 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0080091  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3409  hypothetical protein  64.13 
 
 
137 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3341  hypothetical protein  70.11 
 
 
151 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06030  hypothetical protein  54.26 
 
 
138 aa  120  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.824286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6865  hypothetical protein  55.83 
 
 
125 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.915134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5115  hypothetical protein  57.03 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104477  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5050  hypothetical protein  62.5 
 
 
125 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8989  hypothetical protein  63.44 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18580  hypothetical protein  52.85 
 
 
133 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0162  hypothetical protein  61.29 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4764  hypothetical protein  57.8 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4386  hypothetical protein  60.2 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6144  hypothetical protein  59.57 
 
 
115 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645069  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7211  hypothetical protein  57.45 
 
 
336 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0943  hypothetical protein  53.17 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.506387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4925  hypothetical protein  48.8 
 
 
130 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4629  hypothetical protein  48.8 
 
 
130 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4542  hypothetical protein  48.8 
 
 
130 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0295  hypothetical protein  53.19 
 
 
255 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  56.52 
 
 
270 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1633  hypothetical protein  50.4 
 
 
129 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0302  hypothetical protein  66.67 
 
 
146 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4320  hypothetical protein  48.67 
 
 
119 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2073  hypothetical protein  58.14 
 
 
198 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10822  hypothetical protein  47.2 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3577  hypothetical protein  51.24 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.345774  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1391  hypothetical protein  42.22 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0022  hypothetical protein  45.45 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>