168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  100 
 
 		 409 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  61.26 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  63.11 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  58.02 
 
 		 407 aa  391  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  52.39 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  52.49 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  53.35 
 
 		 408 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  52.82 
 
 		 372 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  51.81 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  51.41 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  50.51 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  47.35 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  52.06 
 
 		 420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  47.84 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  46.35 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  50.67 
 
 		 379 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  50.66 
 
 		 376 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  48.55 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  49.87 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  47.29 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  42.53 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  45.05 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  36.6 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.67 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  38.69 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  38.68 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  37.14 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  37.14 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  37.14 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  38.04 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  34.2 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  37.33 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  34.54 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  38.96 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  37.59 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  42.63 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  36.66 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  37.31 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  36.53 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  37.31 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  37.05 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  37.64 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  37.31 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  35.14 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  36.13 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  37.05 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  36.44 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  36.67 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  34.01 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  36.43 
 
 		 389 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  40.96 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.75 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  34.98 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  39.07 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.89 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.14 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  40 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.25 
 
 		 392 aa  211  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  32.41 
 
 		 389 aa  209  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  33.33 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  43.9 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  35.31 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  35.05 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  35.05 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  35.05 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  36.71 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  35.05 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  37.5 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  34.88 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  35.05 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  33.08 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  34.79 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  35.25 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  34.92 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  35.22 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  36.66 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  34.79 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  34.83 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  33.67 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  38.81 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  35.97 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  33.83 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.79 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  37.8 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  33.5 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  35.71 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  36.11 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  37.88 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  33.93 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  40.98 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  35.25 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  37.03 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  32.87 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  34.68 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  31.35 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  36.49 
 
 		 357 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  32.65 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  35.71 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  35.18 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  34.33 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>